חכם יוסף ברדוגו נולד בעיר מכנאס שבמרוקו. כבר בילדותו נודע כמתמיד גדול והיה מסתגר בבית המדרש הסמוך לביתו ועוסק בתורה יומם ולילה.
בהיות כבן שבע עשרה שנים חיבר ספר בשם "טוב עין" על הש"ס. וביאור על "משנה תורה" להרמב"ם,
בשנת ה'ת"ר (1840) נתמנה לדיין בבית דינו של חכם יעקב ברדוגו ולאחר כמה שנים לאחר פטירתו של חכם יעקב מונה לאב"ד.
בשנת ה'תר"ח (1848) נקנסה הקהילה היהודית במכנאס בקנס כספי כבד עקב עלילה, בכדי לאלץ את אנשי הקהילה לשלם במהירות את הקנס, תפסו את רבני העיר ובהם חכם יוסף ושמו אותם במאסר עד תשלום הקנס.
חיבר ספרים רבים, ביניהם, "כתונת פסים", "יבין שמועה", "שופט בצדק", "אהבת יוסף", "עדות ביהוסף", "דברי יוסף".
נפטר בט"ז כסלו ה'תרי"ד (1854)